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这才不是剧透。

第一章 来自贝拿勒斯的信

折木奉太郎受到了姐姐折木供惠给他寄的信。姐姐信中在祝贺弟弟考上高中时，向弟弟提出了去加入古籍研究社的建议。为什么？

第二章 深具传统的古籍研究社之重生

奉太郎打算和旧友里志一起去古籍研究社看看，不料却撞见大小姐千反田爱瑠。当奉太郎准备回家时，却发现活动室在千反田进入后被反锁成了密室。感到好奇的千反田决定找出真相。他们最终是否找出反锁的原因？千反田为何强行让奉太郎加入研究社？迷雾就此散开……

第三章 值得夸耀的古籍研究社之活动

打算参加神高文化祭的古籍研究社全体，在去图书馆查找社刊的相关资料时，被管理员伊原摩耶花告知《神山高中五十年的轨迹》这本书连续五周被人在选修课前借走，课后又会还回。这是怎么回事？奉太郎又是如何知道答案的？千反田的计划也浮出了水面……

第四章 另有隐情的估计研究社之后裔

千反田决定单独与奉太郎会面，寻求他的帮助，寻找失踪舅舅关谷纯的过去。关谷纯曾是古籍研究社的一员，后来因为某事件休学，进而失踪。在那之前，他对年幼的千反田说了句让年幼的千反田大哭不止的话。 是什么？他又为何休学？

第五章 其来有自的古籍研究社之封印

奉太郎从姐姐的回信中得知，社刊可能在活动室的药品柜里。路上奉太郎打听到社办在两年前搬到过生物教室，在活动室寻觅未果的他们又只好前往那里。颇费周折后，终于找到了社刊《冰菓》，却只有第二期。第一期的《冰菓》中隐藏的关谷纯事件真相还未被发现。

第六章 绽放荣光的古籍研究社之过往

古籍研究社的全体成员决定召开会议来讨论《冰菓》的下落，关谷纯事件的真相。在各自报告了自己的证据和结论后，奉太郎推理出了时间的真相。三十三年前的学运，一个英雄的传奇。千反田的求助看似解决了……但仅仅如此，解释得了当年的为何会千反田嚎哭吗？

第七章 走过历史的古籍研究社之真相

对自己的结论心存疑惑的奉太郎，在伊原的帮助下，他找到了三十三年前事件的记录者，系鱼川老师。在系鱼川老师的叙述中，众人得知了事件的真相。关谷纯给社刊命名为《冰菓》的背后，是一个让人叹息的结局。

第八章 迈向未来的古籍研究社之日常

寻找到了三十三年前的真相的古籍研究社社员们，决定以详实的事件还原作为临近的校园祭发行的社刊。终于，每个人的生活回归了日常之中。

第九章 寄往萨拉热窝的信

奉太郎给姐姐回了封信，感谢了姐姐当初的建议，因为他借此终于找到了自己理想中的……青春。