デジモンストーリー サイバースルゥース ハッカーズメモリーズ

近未来的日本。
「EDEN」藉由革命性的虚拟实景技术与网络服务而成立，为世界上规模最大的电脑空间，对人们已成为另一个现实世界。
另一个日常般的存在。

而「骇客」，便是威胁这安稳日常的存在。
他们使用特殊的病毒程序，突破牢固的安全措施，篡改重要资料。
对电脑世界带来莫大的损害。

他们所使用的病毒程序具有高度的人工智能，会学习、成长，并有着各式各样的进化能力。

而人们将这可怕的病毒程序称呼为「数码宝贝」……

在现实与电脑空间的边界线越来越稀薄的近未来东京，「EDEN账号」既是访问电脑空间的凭证，也作为自己的身份证明。

但某一天，主人公自己的EDEN账号却被入侵，在自己毫不察觉的情况下被诬陷成了账号狩猎。想洗刷清白也没有证据，没有住所的主人公，为了证明自己是被冤枉的，得到数码宝贝，只身进入骇客们的休息厅。

然而却被骇客困住陷入危机，幸被正在进行账号狩猎调查的「Hudie」的首领御岛龙司所救。

主人公驱使数码宝贝的能力被御岛龙司看中，担心他单独调查账号狩猎很危险，于是招他入队。
就这样主人公一边作为「Hudie」的成员解决电脑空间的麻烦事，一边不断调查陷害自己的黑骇客的真面目……