ポケットモンスターSPECIAL‎ 漫画系列

　　《神奇宝贝特别篇》是神奇宝贝的漫画中最受欢迎的一部。目前全部已经连载了500回以上。
　　故事情节主要是跟随神奇宝贝的主线游戏（从最初的“红.绿”版开始）进行的。这个漫画最大特点之一，每个主角分别对应任天堂所推出电玩版本（小蓝虽然是对应蓝版，但蓝版游戏中并未有女主角。不过任天堂其实构思过小蓝的造型，游戏中是在火红.叶绿版才登场。另外，火红.叶绿版男主角则和红、绿版一样为小智和小茂，心金.魂银版则同为阿金和阿银。）。这个代表角色不只是游戏中的登场人物，更有些（如小洛、米拉特）是《神奇宝贝特别篇》的原创角色（当然，还是以游戏登场角色为多）。随着版本增多，主角也会越来越多。
　　故事的每一回标题几乎都是《VS XXX（XXX是某几只神奇宝贝）》（第三、四、六章的最终决战与第五章除外）。此外，故事虽然是以游戏情节为蓝本，但对于神奇宝贝的对战、世界观以及情节等等却有着一套自己的系统（和动画、电玩的设定有不少出入）。
　　虽然同样以神奇宝贝为主角，人物也有不少重复，但特别篇可以说完全以战斗为主题，结构较为严谨，相较动画走轻松路调，这是两者最大的不同之处。